Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms