Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL40Q2TBA0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms