Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTF1Q16619 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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