Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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EXT1Q16394 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EXT1Q16394 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EXT1Q16394 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EXT1Q16394 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EXT1Q16394 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EXT1Q16394 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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