Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms