Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IHHQ14623 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IHHQ14623 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms