Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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