Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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