Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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