Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms