Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDC20Q12834 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CDC20Q12834 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms