Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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