Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms