Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms