Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN2Q02246 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms