Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms