Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ACTBP60709 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ACTBP60709 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ACTBP60709 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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