Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms