Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPOLAP51003 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPOLAP51003 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms