Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms