Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NESP48681 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NESP48681 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NESP48681 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms