Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms