Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms