Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms