Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CTSSP25774 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTSSP25774 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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