Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms