Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms