Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF1P10914 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF1P10914 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms