Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms