Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms