Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms