Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC9O60706 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms