Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms