Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms