Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms