Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPA4Q9UI42 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms