Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HDAC6Q9UBN7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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