Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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