Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A4GALTQ9NPC4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms