Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms