Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms