Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms