Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms