Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms