Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms