Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCDD1LQ8NCL9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms