Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms