Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms