Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms