Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF549Q6P9A3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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